O tratamento da fibromialgia é multidisciplinar e continuado, enfatizando a participação ativa e conscientização do paciente, em conjunto com medicação, terapia e realização de exercícios físicos. Como a etiologia é desconhecida, os objetivos do tratamento são controle da dor e melhora da qualidade de vida do paciente.
Medicamentos como os inibidores seletivos da recaptação de serotonina (fluoxetina), usados isoladamente, não têm bons resultados, mas podem ser especialmente eficientes quando associados a outros medicamentos.